Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms