Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim35Q8C006 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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