Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Iffo1Q8BXL9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Iffo1Q8BXL9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Iffo1Q8BXL9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Iffo1Q8BXL9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Iffo1Q8BXL9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Iffo1Q8BXL9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Iffo1Q8BXL9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Iffo1Q8BXL9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Iffo1Q8BXL9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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