Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4aQ8BW72 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms