Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod1Q8BVA4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms