Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Pggt1bQ8BUY9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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