Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW9

Slfnl1, Schlafen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfnl1Q8BHW9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfnl1Q8BHW9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfnl1Q8BHW9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfnl1Q8BHW9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfnl1Q8BHW9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfnl1Q8BHW9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms