Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm29Q8BGX2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms