Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NanogQ80Z64 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NanogQ80Z64 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NanogQ80Z64 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NanogQ80Z64 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NanogQ80Z64 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NanogQ80Z64 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NanogQ80Z64 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NanogQ80Z64 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NanogQ80Z64 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NanogQ80Z64 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms