Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg2bQ80XK6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg2bQ80XK6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2bQ80XK6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2bQ80XK6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2bQ80XK6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2bQ80XK6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2bQ80XK6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2bQ80XK6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2bQ80XK6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2bQ80XK6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2bQ80XK6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms