Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AknaQ80VW7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AknaQ80VW7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AknaQ80VW7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
AknaQ80VW7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AknaQ80VW7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AknaQ80VW7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AknaQ80VW7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AknaQ80VW7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms