Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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