Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc155Q80VJ8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms