Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms