Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo2Q7TSY8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms