Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2q1Q7TSS2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms