Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IfnkQ7TSL0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms