Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms