Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actn1Q7TPR4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actn1Q7TPR4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms