Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mycbp2Q7TPH6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms