Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms