Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd1l2Q7TN88 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms