Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smap2Q7TN29 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smap2Q7TN29 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms