Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms