Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tigd3Q7TM95 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tigd3Q7TM95 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms