Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms