Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed3Q78IS1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms