Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GypcQ78HU7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GypcQ78HU7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms