Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms