Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms