Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b3Q6UQ17 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b3Q6UQ17 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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