Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Slc9c1Q6UJY2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc9c1Q6UJY2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9c1Q6UJY2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9c1Q6UJY2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9c1Q6UJY2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9c1Q6UJY2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9c1Q6UJY2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9c1Q6UJY2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9c1Q6UJY2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9c1Q6UJY2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9c1Q6UJY2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9c1Q6UJY2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9c1Q6UJY2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9c1Q6UJY2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms