Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rab35Q6PHN9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rab35Q6PHN9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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