Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC7

Slc35e3, Solute carrier family 35 member E3, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e3Q6PGC7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc35e3Q6PGC7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms