Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim45Q6PFY8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim45Q6PFY8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms