Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf4Q6PFF0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms