Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp40Q6PE01 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms