Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms