Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc3bQ6PDC0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms