Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Herc4Q6PAV2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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