Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms