Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh2Q6P6J4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms