Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc148Q6P5U8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms