Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nwd2Q6P5U7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nwd2Q6P5U7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms