Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg2aQ6P4T0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg2aQ6P4T0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms