Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nsd3Q6P2L6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsd3Q6P2L6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms