Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm2bQ6P1G2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms