Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms