Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ltv1Q6NSQ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms