Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep78Q6IRU7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep78Q6IRU7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep78Q6IRU7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep78Q6IRU7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep78Q6IRU7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep78Q6IRU7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep78Q6IRU7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep78Q6IRU7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms